В качестве основных целевых показателей реализации стратегии определены: охват медицинским освидетельствованием на ВИЧ-инфекцию населения России; доля зараженных ВИЧ, получающих антиретровирусную терапию от общего числа больных, состоящих под диспансерным наблюдением.
Кроме того, результаты реализации стратегии будут оцениваться «по показателю информированности населения в возрасте 18–49 лет по вопросам ВИЧ-инфекции» и разработке программ по сокращению ВИЧ-инфекции среди наркоманов.
В правительстве ожидают, что стратегия к 2020 году позволит снизить число новых случаев ВИЧ-инфекции, увеличить охват россиян, прошедших медицинское тестирование на ВИЧ, а также сократить частоту развития осложнений и смерти от ассоциированных с ВИЧ заболеваний.